Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
RPRD2Q5VT52 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
RPRD2Q5VT52 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RPRD2Q5VT52 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RPRD2Q5VT52 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RPRD2Q5VT52 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
RPRD2Q5VT52 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
RPRD2Q5VT52 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
RPRD2Q5VT52 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms