Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXM2

SNAPC4, snRNA-activating protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC4Q5SXM2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SNAPC4Q5SXM2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SNAPC4Q5SXM2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SNAPC4Q5SXM2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SNAPC4Q5SXM2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
SNAPC4Q5SXM2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SNAPC4Q5SXM2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SNAPC4Q5SXM2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SNAPC4Q5SXM2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SNAPC4Q5SXM2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SNAPC4Q5SXM2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SNAPC4Q5SXM2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SNAPC4Q5SXM2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SNAPC4Q5SXM2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SNAPC4Q5SXM2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
SNAPC4Q5SXM2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SNAPC4Q5SXM2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SNAPC4Q5SXM2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SNAPC4Q5SXM2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SNAPC4Q5SXM2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SNAPC4Q5SXM2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SNAPC4Q5SXM2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SNAPC4Q5SXM2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SNAPC4Q5SXM2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SNAPC4Q5SXM2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SNAPC4Q5SXM2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SNAPC4Q5SXM2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
SNAPC4Q5SXM2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
SNAPC4Q5SXM2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
SNAPC4Q5SXM2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
SNAPC4Q5SXM2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
SNAPC4Q5SXM2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
SNAPC4Q5SXM2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
SNAPC4Q5SXM2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
SNAPC4Q5SXM2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SNAPC4Q5SXM2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SNAPC4Q5SXM2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SNAPC4Q5SXM2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SNAPC4Q5SXM2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
SNAPC4Q5SXM2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SNAPC4Q5SXM2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SNAPC4Q5SXM2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SNAPC4Q5SXM2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
SNAPC4Q5SXM2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SNAPC4Q5SXM2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SNAPC4Q5SXM2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SNAPC4Q5SXM2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SNAPC4Q5SXM2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SNAPC4Q5SXM2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SNAPC4Q5SXM2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SNAPC4Q5SXM2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SNAPC4Q5SXM2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SNAPC4Q5SXM2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SNAPC4Q5SXM2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SNAPC4Q5SXM2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SNAPC4Q5SXM2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SNAPC4Q5SXM2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
SNAPC4Q5SXM2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SNAPC4Q5SXM2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SNAPC4Q5SXM2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SNAPC4Q5SXM2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SNAPC4Q5SXM2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SNAPC4Q5SXM2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SNAPC4Q5SXM2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SNAPC4Q5SXM2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SNAPC4Q5SXM2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SNAPC4Q5SXM2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SNAPC4Q5SXM2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SNAPC4Q5SXM2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SNAPC4Q5SXM2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SNAPC4Q5SXM2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SNAPC4Q5SXM2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SNAPC4Q5SXM2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SNAPC4Q5SXM2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SNAPC4Q5SXM2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 659.6 ms