Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FRMPD3Q5JV73 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMPD3Q5JV73 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms