Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUX0

SPIN3, Spindlin-3, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3Q5JUX0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPIN3Q5JUX0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPIN3Q5JUX0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPIN3Q5JUX0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPIN3Q5JUX0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPIN3Q5JUX0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPIN3Q5JUX0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPIN3Q5JUX0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPIN3Q5JUX0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPIN3Q5JUX0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPIN3Q5JUX0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPIN3Q5JUX0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIN3Q5JUX0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIN3Q5JUX0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIN3Q5JUX0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIN3Q5JUX0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIN3Q5JUX0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIN3Q5JUX0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIN3Q5JUX0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIN3Q5JUX0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIN3Q5JUX0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIN3Q5JUX0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIN3Q5JUX0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIN3Q5JUX0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIN3Q5JUX0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIN3Q5JUX0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms