Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYW3

RTL5, Retrotransposon Gag-like protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL5Q5HYW3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RTL5Q5HYW3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RTL5Q5HYW3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms