Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HERC4Q5GLZ8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms