Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM4

ZNF542P, Putative zinc finger protein 542, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF542PQ5EBM4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF542PQ5EBM4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF542PQ5EBM4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF542PQ5EBM4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF542PQ5EBM4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF542PQ5EBM4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF542PQ5EBM4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF542PQ5EBM4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF542PQ5EBM4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF542PQ5EBM4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF542PQ5EBM4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF542PQ5EBM4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF542PQ5EBM4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF542PQ5EBM4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF542PQ5EBM4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF542PQ5EBM4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF542PQ5EBM4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF542PQ5EBM4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF542PQ5EBM4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF542PQ5EBM4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF542PQ5EBM4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF542PQ5EBM4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF542PQ5EBM4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF542PQ5EBM4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF542PQ5EBM4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF542PQ5EBM4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF542PQ5EBM4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF542PQ5EBM4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF542PQ5EBM4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF542PQ5EBM4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF542PQ5EBM4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF542PQ5EBM4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF542PQ5EBM4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF542PQ5EBM4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms