Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ODF2Q5BJF6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms