Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPL39P5Q59GN2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL39P5Q59GN2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms