Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP29Q52LW3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms