Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LONRF3Q496Y0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LONRF3Q496Y0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms