Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KRT71Q3SY84 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms