Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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