Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL98

VMAC, Vimentin-type intermediate filament-associated coiled-coil protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMACQ2NL98 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VMACQ2NL98 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
VMACQ2NL98 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VMACQ2NL98 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VMACQ2NL98 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VMACQ2NL98 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VMACQ2NL98 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VMACQ2NL98 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VMACQ2NL98 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VMACQ2NL98 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
VMACQ2NL98 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VMACQ2NL98 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VMACQ2NL98 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
VMACQ2NL98 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VMACQ2NL98 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VMACQ2NL98 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VMACQ2NL98 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VMACQ2NL98 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VMACQ2NL98 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VMACQ2NL98 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VMACQ2NL98 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VMACQ2NL98 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VMACQ2NL98 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VMACQ2NL98 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VMACQ2NL98 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VMACQ2NL98 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VMACQ2NL98 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VMACQ2NL98 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
VMACQ2NL98 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VMACQ2NL98 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VMACQ2NL98 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VMACQ2NL98 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VMACQ2NL98 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms