Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSPP1Q1MSJ5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CSPP1Q1MSJ5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms