Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM187BQ17R55 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM187BQ17R55 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
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