Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TXNRD1Q16881 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TXNRD1Q16881 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TXNRD1Q16881 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TXNRD1Q16881 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TXNRD1Q16881 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TXNRD1Q16881 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TXNRD1Q16881 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TXNRD1Q16881 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TXNRD1Q16881 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TXNRD1Q16881 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TXNRD1Q16881 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TXNRD1Q16881 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TXNRD1Q16881 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TXNRD1Q16881 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TXNRD1Q16881 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TXNRD1Q16881 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TXNRD1Q16881 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TXNRD1Q16881 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
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TXNRD1Q16881 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
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TXNRD1Q16881 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TXNRD1Q16881 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TXNRD1Q16881 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
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TXNRD1Q16881 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
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TXNRD1Q16881 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TXNRD1Q16881 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TXNRD1Q16881 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
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TXNRD1Q16881 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TXNRD1Q16881 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TXNRD1Q16881 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TXNRD1Q16881 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TXNRD1Q16881 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TXNRD1Q16881 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TXNRD1Q16881 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TXNRD1Q16881 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TXNRD1Q16881 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TXNRD1Q16881 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TXNRD1Q16881 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TXNRD1Q16881 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TXNRD1Q16881 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TXNRD1Q16881 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TXNRD1Q16881 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TXNRD1Q16881 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TXNRD1Q16881 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TXNRD1Q16881 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TXNRD1Q16881 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TXNRD1Q16881 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TXNRD1Q16881 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TXNRD1Q16881 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TXNRD1Q16881 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TXNRD1Q16881 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
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