Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRNQ16849 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRNQ16849 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms