Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
PPP1R3AQ16821 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP1R3AQ16821 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP1R3AQ16821 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP1R3AQ16821 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP1R3AQ16821 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP1R3AQ16821 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP1R3AQ16821 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP1R3AQ16821 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP1R3AQ16821 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP1R3AQ16821 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP1R3AQ16821 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP1R3AQ16821 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP1R3AQ16821 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP1R3AQ16821 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP1R3AQ16821 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP1R3AQ16821 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP1R3AQ16821 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP1R3AQ16821 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP1R3AQ16821 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP1R3AQ16821 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP1R3AQ16821 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP1R3AQ16821 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP1R3AQ16821 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP1R3AQ16821 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP1R3AQ16821 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP1R3AQ16821 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP1R3AQ16821 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP1R3AQ16821 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP1R3AQ16821 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP1R3AQ16821 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP1R3AQ16821 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP1R3AQ16821 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP1R3AQ16821 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP1R3AQ16821 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP1R3AQ16821 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP1R3AQ16821 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP1R3AQ16821 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP1R3AQ16821 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP1R3AQ16821 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP1R3AQ16821 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP1R3AQ16821 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP1R3AQ16821 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms