Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGCBQ16585 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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