Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ACKR1Q16570 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACKR1Q16570 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ACKR1Q16570 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ACKR1Q16570 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACKR1Q16570 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACKR1Q16570 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACKR1Q16570 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ACKR1Q16570 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACKR1Q16570 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACKR1Q16570 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACKR1Q16570 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACKR1Q16570 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACKR1Q16570 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACKR1Q16570 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACKR1Q16570 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACKR1Q16570 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACKR1Q16570 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACKR1Q16570 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACKR1Q16570 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACKR1Q16570 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACKR1Q16570 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACKR1Q16570 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACKR1Q16570 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACKR1Q16570 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACKR1Q16570 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACKR1Q16570 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACKR1Q16570 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACKR1Q16570 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACKR1Q16570 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACKR1Q16570 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACKR1Q16570 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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