Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CSRP2Q16527 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CSRP2Q16527 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRP2Q16527 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRP2Q16527 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRP2Q16527 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRP2Q16527 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRP2Q16527 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRP2Q16527 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRP2Q16527 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRP2Q16527 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRP2Q16527 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRP2Q16527 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRP2Q16527 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRP2Q16527 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRP2Q16527 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRP2Q16527 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRP2Q16527 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRP2Q16527 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRP2Q16527 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRP2Q16527 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRP2Q16527 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRP2Q16527 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRP2Q16527 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRP2Q16527 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSRP2Q16527 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRP2Q16527 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRP2Q16527 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRP2Q16527 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRP2Q16527 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRP2Q16527 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSRP2Q16527 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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