Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PDCD2Q16342 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
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