Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF56Q15929 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF56Q15929 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF56Q15929 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF56Q15929 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF56Q15929 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF56Q15929 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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ZNF56Q15929 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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ZNF56Q15929 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF56Q15929 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF56Q15929 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF56Q15929 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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ZNF56Q15929 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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ZNF56Q15929 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF56Q15929 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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ZNF56Q15929 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF56Q15929 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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ZNF56Q15929 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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ZNF56Q15929 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF56Q15929 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF56Q15929 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF56Q15929 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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ZNF56Q15929 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF56Q15929 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF56Q15929 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF56Q15929 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF56Q15929 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF56Q15929 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF56Q15929 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF56Q15929 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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ZNF56Q15929 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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ZNF56Q15929 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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ZNF56Q15929 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF56Q15929 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF56Q15929 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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ZNF56Q15929 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF56Q15929 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF56Q15929 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF56Q15929 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF56Q15929 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF56Q15929 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF56Q15929 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF56Q15929 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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