Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZFHX3Q15911 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZFHX3Q15911 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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