Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIX1Q15475 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms