Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NKX1-1Q15270 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NKX1-1Q15270 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms