Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDCD1Q15116 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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