Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAB3GAP1Q15042 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RAB3GAP1Q15042 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB3GAP1Q15042 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
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