Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERC3Q15034 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HERC3Q15034 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERC3Q15034 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERC3Q15034 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERC3Q15034 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERC3Q15034 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERC3Q15034 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERC3Q15034 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERC3Q15034 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERC3Q15034 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HERC3Q15034 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HERC3Q15034 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERC3Q15034 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HERC3Q15034 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HERC3Q15034 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERC3Q15034 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
HERC3Q15034 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
HERC3Q15034 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERC3Q15034 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERC3Q15034 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERC3Q15034 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERC3Q15034 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERC3Q15034 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HERC3Q15034 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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