Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF1Q14990 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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ODF1Q14990 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF1Q14990 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
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