Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMCO1Q147U7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMCO1Q147U7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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