Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRP1BQ14684 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRP1BQ14684 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
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