Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SQLEQ14534 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SQLEQ14534 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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