Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNQ14247 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNQ14247 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTTNQ14247 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTTNQ14247 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTTNQ14247 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTTNQ14247 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTTNQ14247 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTTNQ14247 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTTNQ14247 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTTNQ14247 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTTNQ14247 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTTNQ14247 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CTTNQ14247 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTTNQ14247 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTTNQ14247 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTTNQ14247 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTTNQ14247 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTTNQ14247 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTTNQ14247 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTTNQ14247 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTTNQ14247 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTTNQ14247 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTTNQ14247 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTTNQ14247 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNQ14247 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNQ14247 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNQ14247 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNQ14247 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNQ14247 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNQ14247 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNQ14247 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNQ14247 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNQ14247 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNQ14247 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNQ14247 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNQ14247 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNQ14247 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNQ14247 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTTNQ14247 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTTNQ14247 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTTNQ14247 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTTNQ14247 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTTNQ14247 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTTNQ14247 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTTNQ14247 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTTNQ14247 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTTNQ14247 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms