Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CNGB1Q14028 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CNGB1Q14028 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
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