Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PDE6HQ13956 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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