Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL3Q13618 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL3Q13618 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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