Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NEUROD1Q13562 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NEUROD1Q13562 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NEUROD1Q13562 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms