Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TOP3AQ13472 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TOP3AQ13472 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOP3AQ13472 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOP3AQ13472 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOP3AQ13472 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOP3AQ13472 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOP3AQ13472 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOP3AQ13472 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOP3AQ13472 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOP3AQ13472 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOP3AQ13472 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOP3AQ13472 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOP3AQ13472 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOP3AQ13472 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOP3AQ13472 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOP3AQ13472 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOP3AQ13472 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOP3AQ13472 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms