Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SF3B2Q13435 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SF3B2Q13435 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
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