Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PMS2P3Q13401 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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