Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKAA1Q13131 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PRKAA1Q13131 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKAA1Q13131 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKAA1Q13131 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKAA1Q13131 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKAA1Q13131 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKAA1Q13131 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKAA1Q13131 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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