Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CHAF1AQ13111 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHAF1AQ13111 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHAF1AQ13111 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
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