Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ECH1Q13011 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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