Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIK3Q13003 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIK3Q13003 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
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