Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFX1Q12986 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFX1Q12986 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
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