Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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