Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TROQ12816 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TROQ12816 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TROQ12816 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TROQ12816 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TROQ12816 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TROQ12816 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TROQ12816 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TROQ12816 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TROQ12816 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
TROQ12816 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TROQ12816 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TROQ12816 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TROQ12816 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
TROQ12816 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TROQ12816 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TROQ12816 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TROQ12816 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TROQ12816 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TROQ12816 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TROQ12816 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TROQ12816 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TROQ12816 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TROQ12816 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TROQ12816 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TROQ12816 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TROQ12816 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TROQ12816 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TROQ12816 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TROQ12816 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TROQ12816 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TROQ12816 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TROQ12816 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TROQ12816 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TROQ12816 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TROQ12816 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TROQ12816 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TROQ12816 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TROQ12816 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TROQ12816 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TROQ12816 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
TROQ12816 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TROQ12816 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
TROQ12816 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TROQ12816 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
TROQ12816 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TROQ12816 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TROQ12816 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TROQ12816 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TROQ12816 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TROQ12816 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
TROQ12816 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TROQ12816 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TROQ12816 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TROQ12816 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TROQ12816 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TROQ12816 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TROQ12816 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TROQ12816 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TROQ12816 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TROQ12816 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TROQ12816 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TROQ12816 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TROQ12816 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
TROQ12816 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
TROQ12816 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
TROQ12816 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
TROQ12816 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
TROQ12816 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TROQ12816 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
TROQ12816 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
TROQ12816 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
TROQ12816 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
TROQ12816 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
TROQ12816 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC33.81■■■■□ 3
TROQ12816 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TROQ12816 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TROQ12816 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TROQ12816 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TROQ12816 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC33.8■■■■□ 3
TROQ12816 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
TROQ12816 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
TROQ12816 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
TROQ12816 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TROQ12816 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
TROQ12816 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
TROQ12816 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TROQ12816 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
TROQ12816 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC33.79■■■■□ 3
TROQ12816 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TROQ12816 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
TROQ12816 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC33.79■■■■□ 3
TROQ12816 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
TROQ12816 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TROQ12816 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TROQ12816 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC33.79■■■■□ 3
TROQ12816 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
TROQ12816 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC33.78■■■■□ 3
TROQ12816 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
TROQ12816 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms