Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF3C1Q12789 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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GTF3C1Q12789 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
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GTF3C1Q12789 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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GTF3C1Q12789 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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GTF3C1Q12789 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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GTF3C1Q12789 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF3C1Q12789 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C1Q12789 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
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